این کمیته با عضویت ۷ نفر از اساتید و فضلای حوزه و دانشگاه، وظیفه بررسی شرایط و ضوابط اعطای مجوز تأسیس یا لغو مجوز انجمن‌های علمی حوزه علمیه خراسان و ارزیابی عملکرد و نظارت بر آنها را بر اساس آیین‌نامه‌های مصوب شورای اعطا دارد.
انجمن یک تشکل علمی است که از فضلا، استادان و صاحبنظران حوزه علمیه در یک دانش خاص با هدف ارتقا و توسعه گفتمان علمی، در چارچوب ضوابط و مقررات مرکز مدیریت حوزه علمیه خراسان تشکیل می‌شود.
انجمن دارای چهار رکن به ترتیب زیر است: هیئت مؤسس، مجمع عمومی، هیئت مدیره و بازرسان.
هیئت مؤسس عبارتند از جمعی از پژوهشگران و اساتید حوزوی (حداقل 15 نفر) دارای مدرک سطح ۴ یا در حد
آن در زمینه فعالیت انجمن که با کسب مجوز از شورای اعطای مجوزها و امتیازهای علمی اقدام به تشکیل انجمن می‌کنند.
هیئت مدیره انجمن: مجموعه‌ای (۷نفر) از اعضای پیوسته و منتخب مجمع عمومی است که بر اساس سیاست‌های کلان انجمن، به برنامه‌ریزی و هدایت فعالیت‌های آن می‌پردازد.
اعضای انجمن متشکل از اعضای پیوسته، وابسته و افتخاری است که اعضای پیوسته دارای حق رأی در مجمع عمومی و حداقل دارای مدرک سطح چهار یا مدرک دکتری و اعضای وابسته حداقل دارای مدرک سطح سه یا مدرک کارشناسی ارشد و بدون حق رأی می‌باشند.
اعضای انجمن از امتیازاتی از جمله ثبت امتیاز عضویت در کارنامه پژوهشی، اولویت در به‌کارگیری و فعالیت در مراکز و مؤسسات پژوهشی حوزوی، حمایت از تدوین و چاپ و نشر آثار پژوهشی، اولویت در برخورداری از تسهیلات و امکانات رفاهی و مزایای پژوهشی و غیره برخوردار می‌شوند.