این کمیته با عضویت ۷ نفر از اساتید و فضلای حوزه و دانشگاه، وظیفه بررسی شرایط و ضوابط اعطای مجوز تأسیس یا لغو مجوز تأسیس واحدهای پژوهشی حوزه علمیه خراسان و ارزیابی عملکرد و نظارت بر آنها را بر اساس آیین‌نامه‌های مصوب شورای اعطا دارد.
برخی از نکات مهم:
واحدهای پژوهشی در حوزه علمیه خراسان، حداقل متشکل از یک گروه پژوهشی است که در عرصه علوم حوزوی و دانش‌های ابزاری آن و یا بینارشته‌ای دینی و یا مسأله‌ای مدیریتی حوزه در قالب واحدهای حوزوی وابسته و غیر وابسته فعالیت میکند و تا مرحله پژوهشگاه قابل ارتقاء است.
واحدهای پژوهشی در پنج نوع به شرح ذیل قرار می‌گیرند:
۱. گروه پژوهشی: کوچکترین واحد پژوهشی است که درزمینة تخصصی مشخص طبق ضوابط «شورای اعطای مجوزها» ایجاد می‌شود؛
۲. مرکز پژوهشی: دارای حداقل دو گروه پژوهشی مرتبط با مأموریت مرکز پژوهشی است؛
۳. پژوهشکده: دارای حداقل سه گروه پژوهشی مرتبط با مأموریت پژوهشکده است؛
۴. مؤسسة پژوهشی: دارای حداقل شش گروه پژوهشی یا دو پژوهشکده مرتبط با مأموریت مؤسسه است؛
۵. پژوهشگاه: دارای حداقل 9گروه پژوهشی یا سه پژوهشکده مرتبط با مأموریت پژوهشگاه است.